Shadowfax
Διάσημο μέλος
Ο Shadowfax αυτή τη στιγμή δεν είναι συνδεδεμένος. Είναι 31 ετών και Φοιτητής. Έχει γράψει 3,622 μηνύματα.
02-07-13
21:53
Γενικά τα νουκλεϊκά οξέα (DNA & RNA) έχουν 5 είδη αζωτούχων βάσεων: Αδενίνη (A), θυμίνη (T), γουανίνη (G), κυτοσίνη (C) και ουρακίλη (U).
Στο DNA θα βρεις μόνο τις πρώτες τέσσερις: A, T, G, C.
Στο RNA θα βρεις τις ίδιες μόνο που αντί για T έχεις U, άρα: A, U, G, C.
Αρχή συμπληρωματικότητας: Η A κάνει δεσμούς υδρογόνου με T και U. Η G κάνεις δεσμούς υδρογόνου με C.
Άρα, αν έχεις τη DNA αλληλουχία:
AATGCTTA
TTACGAAT
και θες το RNA απ' αυτή, σπάσε τους δύο κλώνους, πάρε τον έναν (π.χ. τον κόκκινο) και αντιστοίχισε κάθε βάση σ' αυτές που υπάρχουν στο RNA:
(DNA): AATGCTTA
(RNA): UUACGAAU
** protip: Δε διαλέγεις τυχαία τον κλώνο για μεταγραφή, but hell, Ιούλιος είναι οπότε φαντάζομαι δεν έχετε μπει ακόμα. Έχε το στο νου σου όμως.
Στο DNA θα βρεις μόνο τις πρώτες τέσσερις: A, T, G, C.
Στο RNA θα βρεις τις ίδιες μόνο που αντί για T έχεις U, άρα: A, U, G, C.
Αρχή συμπληρωματικότητας: Η A κάνει δεσμούς υδρογόνου με T και U. Η G κάνεις δεσμούς υδρογόνου με C.
Άρα, αν έχεις τη DNA αλληλουχία:
AATGCTTA
TTACGAAT
και θες το RNA απ' αυτή, σπάσε τους δύο κλώνους, πάρε τον έναν (π.χ. τον κόκκινο) και αντιστοίχισε κάθε βάση σ' αυτές που υπάρχουν στο RNA:
(DNA): AATGCTTA
(RNA): UUACGAAU
** protip: Δε διαλέγεις τυχαία τον κλώνο για μεταγραφή, but hell, Ιούλιος είναι οπότε φαντάζομαι δεν έχετε μπει ακόμα. Έχε το στο νου σου όμως.
Σημείωση: Το μήνυμα αυτό γράφτηκε 11 χρόνια πριν. Ο συντάκτης του πιθανόν να έχει αλλάξει απόψεις έκτοτε.
Shadowfax
Διάσημο μέλος
Ο Shadowfax αυτή τη στιγμή δεν είναι συνδεδεμένος. Είναι 31 ετών και Φοιτητής. Έχει γράψει 3,622 μηνύματα.
04-10-11
12:23
Για αντιγραφή μιτοχονδριακού dna,το βιβλίο δεν κάνει καμία αναφορά.Επομένως,προσωπικά πιστεύω ότι δεν θα ήταν ασφαλές να κάνεις αναφορά σε κάτι τέτοιο,παρά μόνο αν αναφέρεις στην απάντηση το αμφίβολό της.Πάντως,συμφωνώ με τη σκέψη σου και τη βρίσκω πολύ λογική.
Σίγουρα ρε συ κι ελπίζω καταλαβαίνεις με ποιο σκεπτικό το 'γραψα. Καλό είναι να ξεφεύγεις λίγο απ' την ύλη πού και πού γιατί μπαίνεις σε μια διαδικασία στην οποία έτσι κι αλλιώς θα μπεις σε θέματα που ίσως θέλουν κάτι παραπάνω.
Αμα σε ένα πρόβλημα σε ένα ερώτημά του ζητάει να γραφεί η αλληλουχία των βάσεων του mRNA που κωδικοποιεί την πολυπεπτιδική αλυσίδα ή τον αριθμό των νουκλεοτιδίων του mRNA που κωδικοποιούν τα αμινοξέα θα συμπεριλάβω και αυτά που αντιστουχούν στο κωδικόνιο λήξης; Γιατί βλέπω ότι στις απαντήσεις τα παίρνει και αυτά. Αλλά αφού αυτά δεν κωδικιποιούν αμινοξέα πως γίνεται αυτό;
Στην πρώτη περίπτωση ναι στη δεύτερη όχι.
Δεν ξέρω αυτού του τύπου οι ερωτήσεις μου φαίνεται μπαίνουν απλά για να μπερδέψουν και προσωπικά τουλάχιστον δε θα τις έβαζα σε εξετάσεις.
Όταν μιλάμε για κωδικοποίηση/σύνθεση μορίου τότε το κωδικόνιο λήξης δε μπορείς να το παραλείψεις απ' τη στιγμή που παίζει συγκεκριμένη διαδικασία. Χωρίς αυτό δεν έχεις σύνθεση γιατί πολύ απλά χωρίς αυτό η διαδικασία δε σταματάει. Αν όμως μιλήσεις για κωδικοποίηση αμινοξέων συγκεκριμένα τα νουκλεοτίδια του λήξης δεν τα αναφέρεις απ' τη στιγμή που το κωδικόνιο που συναποτελούν δεν υπάρχει στο γενετικό κώδικα.
Σημείωση: Το μήνυμα αυτό γράφτηκε 12 χρόνια πριν. Ο συντάκτης του πιθανόν να έχει αλλάξει απόψεις έκτοτε.
Shadowfax
Διάσημο μέλος
Ο Shadowfax αυτή τη στιγμή δεν είναι συνδεδεμένος. Είναι 31 ετών και Φοιτητής. Έχει γράψει 3,622 μηνύματα.
26-09-11
00:48
Για την αντιγραφή που τόσο εύκολα την προσπερνάτε, τι παίζει με το μιτοχονδριακό DNA; Γιατί και τα οργανίδια πολλαπλασιάζονται κατά κάποιο τρόπο κι όχι απαραίτητα στο S της μεσόφασης φαντάζομαι. Νομίζω στο G2 παράγονται όσα χρειάζονται και δεν παράχθηκαν στο G1, και αν μιλάμε για μιτοχόνδρια προϋπόθεση είναι φυσικά η αντιγραφή του DNA τους.
Συνολικά δηλαδή έχεις παραπάνω από μία φορά αντιγραφή και, αν τελικά ισχύει, θα 'ταν μαγκιά να μπει στην απάντηση. Για το G2 δείτε το βιβλίο της Β εκεί θυμάμαι το 'χα διαβάσει. Τροφή για σκέψη και ίσως ελάχιστα εκτός ύλης αλλά σιγά, καλά να περνάμε.
Συνολικά δηλαδή έχεις παραπάνω από μία φορά αντιγραφή και, αν τελικά ισχύει, θα 'ταν μαγκιά να μπει στην απάντηση. Για το G2 δείτε το βιβλίο της Β εκεί θυμάμαι το 'χα διαβάσει. Τροφή για σκέψη και ίσως ελάχιστα εκτός ύλης αλλά σιγά, καλά να περνάμε.
Σημείωση: Το μήνυμα αυτό γράφτηκε 12 χρόνια πριν. Ο συντάκτης του πιθανόν να έχει αλλάξει απόψεις έκτοτε.
Shadowfax
Διάσημο μέλος
Ο Shadowfax αυτή τη στιγμή δεν είναι συνδεδεμένος. Είναι 31 ετών και Φοιτητής. Έχει γράψει 3,622 μηνύματα.
31-08-11
02:43
Ε, εντάξει, αν δεις το 2 σελίδα σελίδα είναι μεγαλύτερο, OK. Αν το δεις όμως σαν τρεις διαδικασίες, όπως και πρέπει να το δεις, τότε δεν το καταλαβαίνεις. Το 8 μου 'χε φανεί πιο βαρύ σε μέγεθος.
Σημείωση: Το μήνυμα αυτό γράφτηκε 13 χρόνια πριν. Ο συντάκτης του πιθανόν να έχει αλλάξει απόψεις έκτοτε.
Shadowfax
Διάσημο μέλος
Ο Shadowfax αυτή τη στιγμή δεν είναι συνδεδεμένος. Είναι 31 ετών και Φοιτητής. Έχει γράψει 3,622 μηνύματα.
10-07-11
11:19
Σωστά πιστεύεις.
Σημείωση: Το μήνυμα αυτό γράφτηκε 13 χρόνια πριν. Ο συντάκτης του πιθανόν να έχει αλλάξει απόψεις έκτοτε.
Shadowfax
Διάσημο μέλος
Ο Shadowfax αυτή τη στιγμή δεν είναι συνδεδεμένος. Είναι 31 ετών και Φοιτητής. Έχει γράψει 3,622 μηνύματα.
19-06-11
07:19
Καλησπέρα.
Πιστεύετε ότι υπάρχει κάτι από βιολογία της δευτέρας λυκείου το οποίο θα πρέπει να γνωρίζω πριν αρχίσω τα καλοκαιρίνα μαθήματα στο συγκεκριμένο μάθημα;
Ό,τι έκανες στη Β έκανες. Μην ασχοληθείς καθόλου κι απλά ξεκουράσου μέχρι να ξεκινήσουν τα μαθήματα.
Σημείωση: Το μήνυμα αυτό γράφτηκε 13 χρόνια πριν. Ο συντάκτης του πιθανόν να έχει αλλάξει απόψεις έκτοτε.
Shadowfax
Διάσημο μέλος
Ο Shadowfax αυτή τη στιγμή δεν είναι συνδεδεμένος. Είναι 31 ετών και Φοιτητής. Έχει γράψει 3,622 μηνύματα.
10-04-11
19:16
Η EcoRI θα κόψει το DNA σου παλινδρομικά, μεταξύ G και A σε κάθε αλυσίδα. Θα πάρεις λοιπόν ένα κομμάτι DNA με μονόκλωνα άκρα το οποίο και θα ενσωματώσεις σε ένα πλασμίδιο που έχει κοπεί από την ίδια περιοριστική ενδονουκλεάση. Το ανασυνδυασμένο πλασμίδιο θα μετασχηματίσει ένα βακτήριο το οποίο θ' αρχίσει να αναπαράγεται αφού το τοποθετήσεις σε καλλιέργεια και λοιπά. Ο κλώνος που θα παραχθεί θα αποτελείται από βακτήρια που φέρουν αντίγραφα του ανασυνδυασμένου πλασμιδίου που εισήγαγες στο αρχικό, όπως το εισήγαγες. Θα κλωνοποιηθεί δηλαδή όλο το κομμάτι που ενσωματώθηκε στο αρχικό πλασμίδιο, στην περίπτωσή μας το όλο το ενδιάμεσο κομμάτι.
Φαντάζομαι η άσκηση δε θα σου δίνει ένα χρωμόσωμα(!!) αλλά ένα τμήμα του που στην αρχή και στο τέλος έχει την αλληλουχία που αναγνωρίζει η EcoRI. Προφανώς θα κλωνοποιηθεί το ενδιάμεσο κομμάτι, στην περίπτωση ευκαρυωτικού οργανισμού που σου ζητάει η άσκηση μάλλον. Ακόμα και να σε ρωτήσει κάτι τέτοιο δηλαδή, που δεν αλλά λέμε, λες ότι για να κλωνοποιηθεί το υπόλοιπο τμήμα του χρωμοσώματος -τα εξωτερικά κομμάτια δηλαδή- θα ήθελες άλλο φορέα κλωνοποίησης λόγω μεγέθους του DNA. Θα χρησιμοποιούσες ιό ξερωγώ, όχι πλασμίδιο.
Τέλος πάντων, κράτα ό,τι χρειάζεται στην άσκηση για τώρα. Κάτι άλλο, τα κωδικόνια έναρξης και λήξης δεν είναι ενδεικτικά του κομματιού που κλωνοποιείται. Σε ακραία άσκηση μπορούν να γίνουν χίλια δυο, με περισσότερα από ένα πιθανά τμήματα για κλωνοποίηση, περισσότερα γνωστά κωδικόνια και ούτω καθεξής. Πηγαίνεις με τη θεωρία, μόνο. Το TAG δεν είναι κάτι που ξέρεις έτσι κι αλλιώς, TAC λες.
Για το mRNA χρειάζεται η εκφώνηση, αν και πάλι μάλλον εύκολα είναι τα πράγματα. Εξαρτάται από τον οργανισμό από τον οποίο πήρες το γονίδιο. Αν είναι ευκαρυωτικός έχεις εσώνια και προκύπτει πρόδρομο mRNA το οποίο και ΔΕΝ ωριμάζει (σε βακτήριο είμαστε). Αν είναι προκαρυωτικός κανονικά χωρίς πρόβλημα.
Για τη μετάφραση δες τα δεδομένα της άσκησης. Θα λέει για υποκινητές πιθανότατα άρα, αφού βρεις το TAC (3'-5') κι ένα κωδικόνιο λήξης, θα ξέρεις τι παίζει με όλες τις διαδικασίες. Αν η EcoRI σού έχει χαλάσει τον υποκινητή θες άλλη περιοριστική για να πάρεις προϊόν (δε θα γίνει καν μεταγραφή). Αν όχι, ο υποκινητής θα βρίσκεται μετά την GAATTC ή μπορεί και να πιάνει μερικές βάσεις απ' αυτή. Από εκεί ξεκινάει η μεταγραφή και από το AUG (5'-3') στο mRNA πια η μετάφραση. Αν είμαστε σε αυτή την περίπτωση, η GAATTC ή έστω μέρος της θα ανήκει σε αμετάφραση περιοχή.
Αυτά συνοπτικά και κάπως πρόχειρα. Διάβασε τη θεωρία ξανά πριν πας να λύσεις, καλά την άσκηση και προσεκτικά ό,τι γράφεις.
Good luck.
Φαντάζομαι η άσκηση δε θα σου δίνει ένα χρωμόσωμα(!!) αλλά ένα τμήμα του που στην αρχή και στο τέλος έχει την αλληλουχία που αναγνωρίζει η EcoRI. Προφανώς θα κλωνοποιηθεί το ενδιάμεσο κομμάτι, στην περίπτωση ευκαρυωτικού οργανισμού που σου ζητάει η άσκηση μάλλον. Ακόμα και να σε ρωτήσει κάτι τέτοιο δηλαδή, που δεν αλλά λέμε, λες ότι για να κλωνοποιηθεί το υπόλοιπο τμήμα του χρωμοσώματος -τα εξωτερικά κομμάτια δηλαδή- θα ήθελες άλλο φορέα κλωνοποίησης λόγω μεγέθους του DNA. Θα χρησιμοποιούσες ιό ξερωγώ, όχι πλασμίδιο.
Τέλος πάντων, κράτα ό,τι χρειάζεται στην άσκηση για τώρα. Κάτι άλλο, τα κωδικόνια έναρξης και λήξης δεν είναι ενδεικτικά του κομματιού που κλωνοποιείται. Σε ακραία άσκηση μπορούν να γίνουν χίλια δυο, με περισσότερα από ένα πιθανά τμήματα για κλωνοποίηση, περισσότερα γνωστά κωδικόνια και ούτω καθεξής. Πηγαίνεις με τη θεωρία, μόνο. Το TAG δεν είναι κάτι που ξέρεις έτσι κι αλλιώς, TAC λες.
Για το mRNA χρειάζεται η εκφώνηση, αν και πάλι μάλλον εύκολα είναι τα πράγματα. Εξαρτάται από τον οργανισμό από τον οποίο πήρες το γονίδιο. Αν είναι ευκαρυωτικός έχεις εσώνια και προκύπτει πρόδρομο mRNA το οποίο και ΔΕΝ ωριμάζει (σε βακτήριο είμαστε). Αν είναι προκαρυωτικός κανονικά χωρίς πρόβλημα.
Για τη μετάφραση δες τα δεδομένα της άσκησης. Θα λέει για υποκινητές πιθανότατα άρα, αφού βρεις το TAC (3'-5') κι ένα κωδικόνιο λήξης, θα ξέρεις τι παίζει με όλες τις διαδικασίες. Αν η EcoRI σού έχει χαλάσει τον υποκινητή θες άλλη περιοριστική για να πάρεις προϊόν (δε θα γίνει καν μεταγραφή). Αν όχι, ο υποκινητής θα βρίσκεται μετά την GAATTC ή μπορεί και να πιάνει μερικές βάσεις απ' αυτή. Από εκεί ξεκινάει η μεταγραφή και από το AUG (5'-3') στο mRNA πια η μετάφραση. Αν είμαστε σε αυτή την περίπτωση, η GAATTC ή έστω μέρος της θα ανήκει σε αμετάφραση περιοχή.
Αυτά συνοπτικά και κάπως πρόχειρα. Διάβασε τη θεωρία ξανά πριν πας να λύσεις, καλά την άσκηση και προσεκτικά ό,τι γράφεις.
Good luck.
Σημείωση: Το μήνυμα αυτό γράφτηκε 13 χρόνια πριν. Ο συντάκτης του πιθανόν να έχει αλλάξει απόψεις έκτοτε.
-
Το forum μας χρησιμοποιεί cookies για να βελτιστοποιήσει την εμπειρία σας.
Συνεχίζοντας την περιήγησή σας, συναινείτε στη χρήση cookies στον περιηγητή σας.